Il Comitato d'indirizzo è un organo consultivo a supporto del Consiglio di amministrazione per cui è chiamato a formulare raccomandazioni d'indirizzo e linee guida specifiche. Ogni Membro dell'Associazione può nominare un rappresentante nel Comitato d'indirizzo.
Il comitato d'indirizzo di Hydroaid (anno 2022) risulta così composto:
- Elena Apollonio, Città Metropolitana di Torino
- Francesco Tresso, Città di Torino
- Armando Quazzo, SMAT
- Francesco Laio, Politecnico di Torino
- Cecilia Mosca, Hydrodata