Il Comitato d'indirizzo è un organo consultivo a supporto del Consiglio di amministrazione per cui è chiamato a formulare raccomandazioni d'indirizzo e linee guida specifiche. Ogni Membro dell'Associazione può nominare un rappresentante nel Comitato d'indirizzo.
Il comitato d'indirizzo di Hydroaid (anno 2024) risulta così composto:
- Elena Apollonio, Città Metropolitana di Torino
- Francesco Tresso, Città di Torino
- Davide Antonio Gandolfi, Regione Piemonte
- Armando Quazzo, SMAT
- Francesco Laio, Politecnico di Torino
- Egidio Dansero, Università di Torino
- Cecilia Mosca, Hydrodata
- Paolo Cugini, ATO3